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> Y la pregunta es, �como se dimensiona el espacio en memoria para
> contener todo esto? El n�mero de l�neas y de valores por l�nea es
> desconocido a priori y arbitrario.
>
Tienes dos opciones:
- Listas enlazadas (la m�s sencilla de implementar, y la que minimizar� la
memoria desperdiciada).
- Arrays que, una vez llenos, redimensiones (con realloc). Esta opci�n es
m�s engorrosa. Util�zala si necesitas b�squedas r�pidas o poder reordenar
los datos. Si el acceso va a ser siempre secuencial, qu�date con la opci�n
anterior.

Un par de consejillos m�s:

Lee las l�neas enteras (o casi), usando fgets. as� podr�s saber cu�ndo
llegas al final del fichero, cu�ndo la l�nea es extremadamente larga, y
cu�ndo has llegado al final de la misma. 
Nada de (x)scanf. Por razones de seguridad y porque es m�s dif�cil localizar
las nuevas l�neas.

Y parsea los n�meros con strtol (si las entradas son siempre n�meros
enteros) o strtod (si las entradas pueden ser n�meros con parte no entera).
Con esto, adem�s de que el recorrido de la l�nea es trivial, consigues
detectar errores en el formato del fichero.

Saludos.