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Article #19

Re: [Q]How to remove RNase

#19
From: Takao Oishi
Date: Sat, 31 Oct 1992 13:39
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 | fj初投稿、工業技術院北海道工業開発試験所の扇谷です。
 | (フルネームを書かないと、「工技院北開試」ではわからないでしょうね)

大石@電総研(同じく工業技術院の組織)です。私もこの件については
詳しい方に教えていただきたく思います。以下には私の乏しい経験に
基づいたことを書きます。

 | autoclaveのスレッドに少し話が出ていたのですが、RNAを取るときの溶液
 |やチューブ、チップ等からのRNaseの除去はどのようにしていらっしゃい
 |ますか。「molecular cloning」や「current protocols in molecular biolog
 |y」などの本では、溶液類はDEPCを添加後、しばらくしてからオートクレー
 |ブで余分なDEPCを飛ばす、チューブは滅菌済みのやつならそのままでOK
 |と書かれていますが。
 |
 | 私は、大学時代に次のように教わったので、そのままやってますが、どうも
 |不安です。
 |(1) 溶液類、チップ、エッペンチューブ、(超)遠心チューブなど
 |    121度、40分オートクレーブ(DEPC処理無し)
 |(2) 電気泳動ラック、送液チューブなどのオートクレーブできないもの
 |    10%過酸化水素水に一晩漬け、上記のように処理した水で洗う
 |(3) ガンマ線滅菌済みプラスチック類
 |    そのまま
 | DEPCを使わないのは、有害なのと、DEPCが残ってしまうとRNAが
 |修飾されてしまう(本当かどうかは良く知りません)ためだと言われたように
 |思います。
 
私も同じような理由で使っていません。しかもオートクレーブは普通の時間しか
かけていないし、泳動ラックも洗いっぱなしです(本当はよくないと思っている
のですが)。後の仕事がノーザンだけならこれでも何とかなるんじゃないですか。

 | DEPCを使った方がいいとは思っているのですが、どうも踏み切れないで
 |います。ノーザンの後、18Sや28Sがテーリングしているのを見る度、や
 |っぱりRNaseかなあ、と悩んでいますので、これら溶液や器具の処理法に
 |ついて教えていただけるとうれしいです。

テーリングですか?分解なら頭の方に出てきませんか?
テーリングならロードする量、濃度などを検討せよと書いた本があった気が
します。私はサブマリンを持っていなかったころ、泳動中にゲル表面が乾いて
テーリングした覚えがありますが、時々バッファーを振りかけてやると収まり
ました(^_^);;。

 | また、RNAの取り方については、スタンダードなグアニヂンチオシアネー
 |トとセシウムクロライド法でやっていますが、AGPC法の方が良いでしょう
 |か。

私の場合は方法と目的が合致した(多数の試料を同時処理できる)ので
AGPC法を使っていますが、セシウムクロライドで取ったほうがきれいだ
と世間一般では言われていると思います。ただ前にも書いたように、ノーザン
ならAGPC法で取ったものが十分使えます。

RNAは取ってすぐノーザンにかけておられるのでしょうか?そうでなければ
保存の問題が大きいと思います。私はついこの間まで水に溶かしたまま
-80℃に置いておいたのですが、これだと2、3ケ月で分解してきますね。
友人に聞くとエタ沈か、泳動用に変性させた状態で保存するのがよいとの
ことでした。

では詳しい方、私からも宜しくお願いします。

大石高生@工業技術院電子技術総合研究所情報科学部脳機能研究室
toishi@etl.go.jp   tel0298-58-5843
Technical Details
Message-ID: <gycSF.toishi@etl.go.jp>
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References: <2675@tukisap.idlabh.go.jp>

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From: toishi@etl.go.jp (Takao Oishi)
Subject: Re: [Q]How to remove RNase
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Reply-To: toishi@etl.go.jp (Takao Oishi)
Organization: Electrotechnical Laboratory, Tsukuba Science City
References: <2675@tukisap.idlabh.go.jp>
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Distribution: fj
Date: Sat, 31 Oct 1992 13:39:15 GMT
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