🚀 go-pugleaf

On Sat, 12 May 2007 14:08:27 +0900, Charles Plessy
<charles-news-nospam@plessy.org> wrote:

>Bonjour a tous les rescap�s du naufrage de fr.sci.biologie,
>
>Dans le cadre d'une tracduction, je bute sur � helix-coil transition �. 
>En anglais, un � coil � est une bobine ou un serpentin si j'ai bien 
>compris. Mais dans le cas de la s�paration d'une paire de 
>polynucl�otides, parler de transition h�lice-serpentin para�t plus que 
>confus.
>
>Voici une page comprenant le texte en question:
>
>http://packages.debian.org/unstable/science/melting
>
>En fait, je pense que je n'ai pas compris le concept de � coil �. Dans 
>certains cas, il semble que cela d�signe les conformations de 
>macromol�cules qui se seraient repli�es au hasard, mais dans le cas du � 
>coiled coil �, il s'agit d'un appariement pr�cis entre deux h�lices 
>alpha, qui si j'ai bien saisi la diff�rence entre une h�lice et un � 
>coil �, ne sont justement pas des � coils �.
>
>J'attend avec impatience vos avis �clair�s :)

Salut,

Pour moi,
L' "Helix-coil transition", c'est la transition double-brin
simple-brin. Pour reprendre l'image donn�e dans la doc de Melting,
c'est comme quand on ouvre une fermeture �clair

Le Nov�re N. (2001). MELTING, computing the melting temperature of
nucleic acid duplex. Bioinformatics, 17: 1226-1227. 
http://tinyurl.com/2vfjm3 [PDF]
(ici : http://www.ebi.ac.uk/~lenov/meltinghome.html )

Melting calcul l'entropie, l'enthalpie et la temp�rature de fusion 
( de d�naturation ) de cette r�action de d�sappariement
ADN/ADN ADN/ARN ARN/ARN
http://tinyurl.com/yqnr78 (Wiki FR)
Pour ce calcul, la page Man en HTML est assez explicite


Niveau vocabulaire :
En Fran�ais, la traduction de "coil" n'est pas unique
Si on prend cela http://tinyurl.com/2bhy5o (Wiki ENG)

- L' "ARN Coil", c'est l'ARN simple brin ( une h�lice Alpha)
R�ciproquement pour l' "ADN Coil"

- Le "Coiled Coil" [http://tinyurl.com/2zvxw9 Wiki ENG],
un double enroulement ou "Super enroulement"
  * La double h�lice, l'entrelacement de 2 h�lices Alpha si elles sont
anti-parall�les ( un appariement ADN/ADN ADN/ARN ARN/ARN)
  * Un domaine, si les h�lices sont parall�les (leucine zipper)

- Le "Random Coil", c'est la pelote statistique.

@+