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Article #10

Cours d'Informatique en Biologie a Pasteur

#10
From: Laurent Bloch
Date: Thu, 25 Aug 1994 16:43
100 lines
4263 bytes
	   Dans la serie des "Cours Pasteur", l'Institut Pasteur organise
	un cours d'Informatique en Biologie dont la prochaine session 
	aura lieu pendant le trimestre janvier-mars 1995. Vous en trouverez
	la description ci-dessous.
	   Il s'agit d'un cours de type universitaire, c'est a dire
	que les frais d'inscription sont symboliques, et non pas d'une 
	session de formation continue. L'inscription est subordonnee a 
	l'avis du Comite du cours. L'enseignement est dispense en
	francais.
	   Pour tous renseignements, s'adresser au Secretariat des 
	Enseignements et des Stages de l'Institut Pasteur, tel. 
	+33 (1) 45 68 81 40.


                          Programme du Cours Pasteur
                          --------------------------

                         Informatique pour la Biologie
                         -----------------------------

   Ce cours a pour objectif de donner a des chercheurs ou de futurs chercheurs
en biologie une formation initiale a l'informatique. Il est reserve aux
titulaires d'une maitrise en biologie ou d'un diplome equivalent.

   L'introduction dans l'activite des biologistes d'outils
informatiques de plus en plus nombreux rend utile l'acquisition par les
chercheurs de competences qui leur permettent de juger les algorithmes mis
en ouvre par les logiciels et d'evaluer les materiels qui leur sont
proposes.

   L'accent est mis sur les aspects fondamentaux de la discipline,
mais certaines applications, a la biologie principalement, sont envisagees
et etudiees.
   Les aspects theoriques de l'informatique sont introduits :
linguistique de la programmation, calculabilite, logique, ainsi que des
domaines techniques comme le systeme, les reseaux et l'architecture des
ordinateurs. La programmation est enseignee selon le paradigme fonctionnel,
mais les styles imperatif et par objets sont aussi abordes.

    Les methodes plus particulierement utilisees en biologie sont
introduites au travers de deux grands domaines : l'analyse de sequences et
la modelisation moleculaire.
    La visee d'un excellent niveau theorique ne devra pas nuire a
l'acquisition de connaissances pratiques directement utiles dans un
laboratoire experimental.

    Ce cours comprend des conferences et des travaux pratiques sur machine.


Algorithmique-Programmation, cours      60 h    

Algorithmique-Programmation, T.P.       30 h    

Theorie des langages                    10 h    

Programmation par objets (cours et TP)  10 h    

Programmation traditionnelle :
 le style imperatif ancien (cours et TP) 6 h     

C et applications systeme (cours et TP) 20 h    

Mise en ouvre des systemes informatiques (TP)   6 h     

Histoire de l'Informatique               5 h    

Perspectives de l'Informatique          10 h    conferences

Logiciels biologiques : Methodes        30 h   

                        Exemples        30 h   

           - dont modelisation moleculaire      

                Installation (gcc)      10 h    

Architecture des machines et urbanisme des
environnements                          10 h    

Logique 		                10 h    

Reseaux                                 10 h    

                                       ___________

                               total : 257 h

Enseignants :

	William Saurin
	Frederic Chauveau
	Harld Wertz
	Daniel Azuelos
	Thierry Rose
	Guy Vaysseix
	Stephane Bortzmeyer
	Catherine Letondal
	Christophe Wolfhugel
	Laurent Bloch
Technical Details
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From: bloch@pasteur.fr (Laurent Bloch)
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Subject: Cours d'Informatique en Biologie a Pasteur
Date: 25 Aug 1994 16:43:37 GMT
Organization: Institut Pasteur, Paris, France
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