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Article #10Cours d'Informatique en Biologie a Pasteur
From: Laurent Bloch
Date: Thu, 25 Aug 1994 16:43
Date: Thu, 25 Aug 1994 16:43
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Dans la serie des "Cours Pasteur", l'Institut Pasteur organise
un cours d'Informatique en Biologie dont la prochaine session
aura lieu pendant le trimestre janvier-mars 1995. Vous en trouverez
la description ci-dessous.
Il s'agit d'un cours de type universitaire, c'est a dire
que les frais d'inscription sont symboliques, et non pas d'une
session de formation continue. L'inscription est subordonnee a
l'avis du Comite du cours. L'enseignement est dispense en
francais.
Pour tous renseignements, s'adresser au Secretariat des
Enseignements et des Stages de l'Institut Pasteur, tel.
+33 (1) 45 68 81 40.
Programme du Cours Pasteur
--------------------------
Informatique pour la Biologie
-----------------------------
Ce cours a pour objectif de donner a des chercheurs ou de futurs chercheurs
en biologie une formation initiale a l'informatique. Il est reserve aux
titulaires d'une maitrise en biologie ou d'un diplome equivalent.
L'introduction dans l'activite des biologistes d'outils
informatiques de plus en plus nombreux rend utile l'acquisition par les
chercheurs de competences qui leur permettent de juger les algorithmes mis
en ouvre par les logiciels et d'evaluer les materiels qui leur sont
proposes.
L'accent est mis sur les aspects fondamentaux de la discipline,
mais certaines applications, a la biologie principalement, sont envisagees
et etudiees.
Les aspects theoriques de l'informatique sont introduits :
linguistique de la programmation, calculabilite, logique, ainsi que des
domaines techniques comme le systeme, les reseaux et l'architecture des
ordinateurs. La programmation est enseignee selon le paradigme fonctionnel,
mais les styles imperatif et par objets sont aussi abordes.
Les methodes plus particulierement utilisees en biologie sont
introduites au travers de deux grands domaines : l'analyse de sequences et
la modelisation moleculaire.
La visee d'un excellent niveau theorique ne devra pas nuire a
l'acquisition de connaissances pratiques directement utiles dans un
laboratoire experimental.
Ce cours comprend des conferences et des travaux pratiques sur machine.
Algorithmique-Programmation, cours 60 h
Algorithmique-Programmation, T.P. 30 h
Theorie des langages 10 h
Programmation par objets (cours et TP) 10 h
Programmation traditionnelle :
le style imperatif ancien (cours et TP) 6 h
C et applications systeme (cours et TP) 20 h
Mise en ouvre des systemes informatiques (TP) 6 h
Histoire de l'Informatique 5 h
Perspectives de l'Informatique 10 h conferences
Logiciels biologiques : Methodes 30 h
Exemples 30 h
- dont modelisation moleculaire
Installation (gcc) 10 h
Architecture des machines et urbanisme des
environnements 10 h
Logique 10 h
Reseaux 10 h
___________
total : 257 h
Enseignants :
William Saurin
Frederic Chauveau
Harld Wertz
Daniel Azuelos
Thierry Rose
Guy Vaysseix
Stephane Bortzmeyer
Catherine Letondal
Christophe Wolfhugel
Laurent Bloch
Technical Details
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