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Article #8

Cours d'Informatique pour biologistes a l'Institut Pasteur

#8
From: Laurent Bloch
Date: Fri, 05 Jul 1996 00:00
87 lines
4299 bytes

	   Dans la s�rie des "Cours Pasteur", l'Institut Pasteur 
	organise un cours d'Informatique en Biologie dont la 
	prochaine session aura lieu pendant le trimestre janvier-
	avril 1997. Vous en trouverez la description ci-dessous.

	   Il s'agit d'un cours de type universitaire et non pas d'une 
	session de formation continue, c'est � dire que les frais 
	d'inscription sont tr�s modiques. L'inscription est subordonn�e � 
	l'avis du Comit� du Cours. L'enseignement est dispens� en 
	fran�ais.
	   Pour tous renseignements, s'adresser au Secr�tariat des 
	Enseignements et des Stages de l'Institut Pasteur, t�l. 
	+33 (1) 45 68 81 40 (ou par courrier �lectronique, �
	algo@pasteur.fr).


                          Programme du Cours Pasteur
                          --------------------------

                           Informatique en Biologie
                           ------------------------

   Ce cours a pour objectif de donner � des chercheurs ou de futurs chercheurs
en biologie une formation initiale � l'informatique. Il est r�serv� aux
titulaires d'une ma�trise en biologie ou d'un dipl�me �quivalent.

   L'introduction dans l'activit� des biologistes d'outils
informatiques de plus en plus nombreux rend utile l'acquisition par les
chercheurs de comp�tences qui leur permettent de juger les algorithmes mis
en oeuvre par les logiciels et d'�valuer les mat�riels qui leur sont
propos�s.

   L'accent est mis sur les aspects fondamentaux de la discipline,
mais certaines applications, � la biologie principalement, sont envisag�es
et etudi�es.
   Les aspects th�oriques de l'informatique sont introduits :
linguistique de la programmation, calculabilit�, logique, ainsi que des
domaines techniques comme le syst�me, les r�seaux et l'architecture des
ordinateurs. La programmation est enseign�e selon le paradigme fonctionnel,
mais les styles imp�ratif et par objets sont aussi abord�s.

    Les m�thodes plus particuli�rement utilis�es en biologie sont
introduites au travers de deux grands domaines : l'analyse de s�quences et
la mod�lisation mol�culaire.
    La vis�e d'un excellent niveau th�orique ne devra pas nuire �
l'acquisition de connaissances pratiques directement utiles dans un
laboratoire experimental.

    Ce cours comprend des conf�rences et des travaux pratiques sur machine :

   Algorithmes et programmation		cours			69h
   Algorithmes et programmation		T.P. (avec Scheme)	52h
   Th�orie des Languages					 9h
   Programmation par objets (avec SmallTalk)			12h
   Programmation imp�rative (avec Fortran)			 6h
   Language C et introduction � la programmation syst�me	12h
   Introduction � Unix et X			T.P.		17h
   Histoire de l'informatique			cours		 6h
   Perspectives de l'informatique		conf�rences	10h
   Algorithmes pour la Biologie
	Algorithmes						45h
	Exemples (Analyse de s�quences et mod�lisation 
		  mol�culaire)			T.P.		27h
   Installation (gcc)						10h
   Architecture des machines et urbanisme des environnements	10h
   Logique							10h
   R�seaux							12h
====================================================================
Total							       307h

Enseignants

	Laurent Bloch
	William Saurin
	Fr�d�ric Chauveau
        Harald Wertz
	Catherine Letondal
	Daniel Azuelos
	�ric Gressier
	Thierry Rose
        Louis Jones
	Guy Vaysseix
	Fran�oise Balmas
	Christophe Wolfhugel
	St�phane Bortzmeyer
Technical Details
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From: bloch@pasteur.fr (Laurent Bloch)
Subject: Cours d'Informatique pour biologistes a l'Institut Pasteur
Date: 1996/07/05
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