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Article #8Cours d'Informatique pour biologistes a l'Institut Pasteur
From: Laurent Bloch
Date: Fri, 05 Jul 1996 00:00
Date: Fri, 05 Jul 1996 00:00
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Dans la s�rie des "Cours Pasteur", l'Institut Pasteur
organise un cours d'Informatique en Biologie dont la
prochaine session aura lieu pendant le trimestre janvier-
avril 1997. Vous en trouverez la description ci-dessous.
Il s'agit d'un cours de type universitaire et non pas d'une
session de formation continue, c'est � dire que les frais
d'inscription sont tr�s modiques. L'inscription est subordonn�e �
l'avis du Comit� du Cours. L'enseignement est dispens� en
fran�ais.
Pour tous renseignements, s'adresser au Secr�tariat des
Enseignements et des Stages de l'Institut Pasteur, t�l.
+33 (1) 45 68 81 40 (ou par courrier �lectronique, �
algo@pasteur.fr).
Programme du Cours Pasteur
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Informatique en Biologie
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Ce cours a pour objectif de donner � des chercheurs ou de futurs chercheurs
en biologie une formation initiale � l'informatique. Il est r�serv� aux
titulaires d'une ma�trise en biologie ou d'un dipl�me �quivalent.
L'introduction dans l'activit� des biologistes d'outils
informatiques de plus en plus nombreux rend utile l'acquisition par les
chercheurs de comp�tences qui leur permettent de juger les algorithmes mis
en oeuvre par les logiciels et d'�valuer les mat�riels qui leur sont
propos�s.
L'accent est mis sur les aspects fondamentaux de la discipline,
mais certaines applications, � la biologie principalement, sont envisag�es
et etudi�es.
Les aspects th�oriques de l'informatique sont introduits :
linguistique de la programmation, calculabilit�, logique, ainsi que des
domaines techniques comme le syst�me, les r�seaux et l'architecture des
ordinateurs. La programmation est enseign�e selon le paradigme fonctionnel,
mais les styles imp�ratif et par objets sont aussi abord�s.
Les m�thodes plus particuli�rement utilis�es en biologie sont
introduites au travers de deux grands domaines : l'analyse de s�quences et
la mod�lisation mol�culaire.
La vis�e d'un excellent niveau th�orique ne devra pas nuire �
l'acquisition de connaissances pratiques directement utiles dans un
laboratoire experimental.
Ce cours comprend des conf�rences et des travaux pratiques sur machine :
Algorithmes et programmation cours 69h
Algorithmes et programmation T.P. (avec Scheme) 52h
Th�orie des Languages 9h
Programmation par objets (avec SmallTalk) 12h
Programmation imp�rative (avec Fortran) 6h
Language C et introduction � la programmation syst�me 12h
Introduction � Unix et X T.P. 17h
Histoire de l'informatique cours 6h
Perspectives de l'informatique conf�rences 10h
Algorithmes pour la Biologie
Algorithmes 45h
Exemples (Analyse de s�quences et mod�lisation
mol�culaire) T.P. 27h
Installation (gcc) 10h
Architecture des machines et urbanisme des environnements 10h
Logique 10h
R�seaux 12h
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Total 307h
Enseignants
Laurent Bloch
William Saurin
Fr�d�ric Chauveau
Harald Wertz
Catherine Letondal
Daniel Azuelos
�ric Gressier
Thierry Rose
Louis Jones
Guy Vaysseix
Fran�oise Balmas
Christophe Wolfhugel
St�phane Bortzmeyer
Technical Details
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